Vrijstaande magnetrons hebben dan wel het voordeel dat ze overal te plaatsen zijn, maar ze kunnen ook hinderlijk zijn. Misschien omdat je het uiterlijk niet mooi vindt of omdat je er gewoonweg geen ruimte voor hebt. In deze gevallen is een inbouw magnetron ideaal. Sommige keukens hebben hier speciaal ruimte voor of je hebt misschien een plek in de kast over. Let er wel op dat je altijd een beetje ruimte overhoudt. Inbouw magnetrons moeten namelijk wel voldoende kunnen ventileren.
Bij het plaatsen van een inbouw magnetron moet je rekening houden met de wijze van het openen van de magnetrondeur. Een magnetrondeur kan namelijk naar de zijkant geopend worden, maar ook met een klapdeur naar beneden.